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例新生儿中个严重遗传性疾病

  • 来源:本站原创
  • 时间:2021/10/6 14:46:01
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新生儿筛查(NBS)是一项成功的公共卫生计划,通过早期发现和管理特定条件来预防发病率和死亡率,可以通过允许及时的治疗干预来改善患有某些危及生命的代谢障碍的儿童的预期寿命。对新生儿进行遗传代谢疾病(IMDs)和其他常见遗传疾病的筛查,现在已成为许多国家新生儿护理的常规组成部分。串联质谱(MS/MS)被广泛用于检测干血斑(DBS)中与氨基酸代谢、有机酸代谢和脂肪酸氧化相关的代谢产物,是目前发达国家检测生化代谢产物的主要方法。在中国,除了MS/MS筛查外,生化NBS还包括用于高苯丙氨酸血症的苯丙氨酸(Phe)测试,用于甲亢或甲状腺功能减退的甲状腺刺激激素(TSH)测试,用于先天性肾上腺增生(CAH)的17-α-羟基孕酮(17-OHP)测试和葡萄糖6磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症的酶促分析。下一代测序(NGS)技术已实现了基因变异的高通量检测。NGS的快速发展降低了测序和遗传分析的成本,因此NGS现在可以在NBS中使用。全基因组测序在美国已经被讨论并应用于名新生儿。结果表明,新生儿基因组测序能够有效地检测目前NBS检测不到的多种疾病的风险和携带者状态,新生儿的基因组测序可以帮助避免患病新生儿的诊断障碍,为受影响的新生儿提供最佳的早期治疗策略,并确定携带者状态,这可以帮助未来的生育规划。在之前的研究中,医院设计了一组与40多个遗传代谢疾病相关的77个基因,并证明了从DBS中提取的基因组DNA能够产生可靠的测序数据,这将使NGS在NBS中作为二级诊断测试发挥作用。考虑到这些益处和挑战,上海医院余永国教授团队和南京诺禾致源共同启动了一个项目,在新生儿筛查与严重遗传性疾病相关的基因变异。根据疾病的患病率和发病年龄,选择了个基因,随机抽取年出生于上海市医院NBS中心的名新生儿作为研究对象,相关结果发表于期刊AnnalsofTranslationalMedicine。结果在生化筛查中,4名婴儿显示G6PD酶活性低,三名新生儿在最初的筛查中显示17-OHP水平升高,在随后的确认测试中被证明是假阳性,TSH、Phe、MS/MS均无异常。在分子筛查中,4名新生儿携带半合子G6PD突变,已被HGMD收录为致病突变。他们就是G6PD酶水平低的4个婴儿,表明G6PD缺乏症分子检测的高敏感性和特异性。除了通过生物化学筛选鉴定的四个样品外,还发现一个个体(ID:)携带两个SLC22A5变异,两个个体(ID:、)各携带两个DUOX2变异。由于新生儿的DUOX2变异(c.A>T和c.C>T)距离比较近,分析出来自同一单体型,所以排除了致病情况。而个体由于父母联系方式丢失未能继续随访。年,召回了ID:个体,并验证了SLC22A5的复合杂合变异。变异c.C>T(p.RX)遗传自父亲,变异c.C>G(p.SC)遗传自母亲(图1)。这两种变异是肉毒碱缺乏症患者的常见突变。图1年个体的MS/MS筛查结果显示游离肉碱降低(C0值:4.3μmol/L,参考:10–60μmol/L),与遗传分析的结果一致,表明出生时的MS/MS结果(C0值:11.6μmol/L,参考:10-60μmol/L)为假阴性。表1列出了在遗传代谢相关基因中携带候选变异的个体。遗传代谢携带者频率本文计算了77个与氨基酸代谢、有机酸代谢和脂肪酸氧化障碍相关的致病基因中可通过MS/MS筛选检测到的突变的携带率,这些新生儿中携带频率最高的前五个基因是PAH(1:56,1.79%),ETFDH(1:81,1.23%),MMACHC(1:87,1.15%),SLC25A13(1:,0.98%)和GCDH(1:,0.80%)(临床相关变异的标准:ClinVar收录的致病/可能致病变异;或HGMD收录的DM和DM?变异;或移码、无义、终止密码子丢失、剪切位点突变;并且人群频率小于0.2%,其他情况见原文)。讨论在过去的十年中,NGS方法已被证明是检测遗传疾病的有效方法,同时其成本已大大降低。我们以前的研究表明,从干血斑中提取的DNA可用于NGS。本文证明NGS筛查和生化筛查相结合可以提高目前NBS的效率。然而,在NBS中筛选变异存在局限性,因为由于缺乏表型等信息,难以评估某些变异的致病性。一些具有高度临床重要性的疾病在技术上也具有挑战性,使得它们难以用NGS进行评估。总之,本研究强调了将NGS筛查与生化筛选查相结合提高NBS效率,这是首次在中国调查导致遗传代谢病的77个基因突变的携带频率。原文出处:


本文编辑:佚名
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